真空滲碳爐操作存在兩方面的安全問題，即爐膛氣氛和排出氣體。

1)由于生產過程中使用碳氫類氣體并生成一定量的氫氣，操作中應嚴格控制空氣或其他含氧類氣體進入爐內，以防止產生混合爆炸，特別是要對爐膛和真空系統進行日常泄漏檢測和壓力上升測試。當氣壓高于6000Pa時，控制泵應確保工藝流程中可能產生的氧氣最大含量和氮氣的氣體濃度保持在稀釋到氧氣的低壓爆炸濃度（4%體積）以下的安全范圍內。采用聯動方式，當稀釋失敗時整個工藝過程可以自動停止，比如當氮氣流量下降到低于安全水平時，使用流量傳感器預警并中斷工作氣體。

2)在含高濃度氫的操作過程中，采用專門安全設備后可以在高爆炸限度之上運行。實際上，通過測量，根據工藝流程中氫氣最小可能含量和任意氣淬氮氣或軸密封氮氣量，確保在氣壓高于6000Pa時，泵中抽運氣體的濃度保持在氫氣高爆炸限度(75.6%)之上的安全范圍內；空氣不能漏入系統中或進入工作中的真空泵；具有包括油封泵的周密封裝置日常更換等適當的維護體制；使用具有軸密封裝置的機械真空泵。該方法也需要采用惰性氣體——氮氣對排氣裝置內易燃易爆氣體進行凈化處理，以使得在最后的排氣孔氣體不能與空氣混合。推薦的高于高爆炸限度的安全工作范圍為小于等于高爆炸限度內殘余氧氣濃度的60%。

從環境方面考慮，需要處理的問題如下：油封泵中油的消耗和處置；系統和排氣裝置的危險隱患的預防；確保爐膛口安全以避免窒息危險。